Το Ίδρυµα διοικείται από 11µελές Διοικητικό Συµβούλιο µε ισόβια µέλη τους ιδρυτές του, Δηµήτρη Μανιατάκη και Ελένη Ταγωνίδη Μανιατάκη.
Στο έργο του Διοικητικού Συµβουλίου συµβάλλει Συµβουλευτική Επιτροπή.
Οι πόροι του Ιδρύµατος προέρχονται από την εκµετάλλευση των περιουσιακών στοιχείων του, καθώς και από ιδιωτικές χορηγίες, δωρεές, κληροδοσίες ή κληρονοµιές προς αυτό.
Τα µέλη του Διοικητικού Συµβουλίου προσφέρουν τις υπηρεσίες τους σε θέµατα που άπτονται των δραστηριοτήτων του Ιδρύµατος και της οικονοµικής διαχείρισης.
Ο πρόεδρος και η αντιπρόεδρος του Δ.Σ. είναι ισόβια µέλη, ενώ όλα τα υπόλοιπα µέλη εκλέγονται µε τριετή θητεία. Το Διοικητικό Συµβούλιο συνεδριάζει στην Αθήνα ή οπουδήποτε παρίστανται όλα τα µέλη του, τακτικά τους µήνες Μάρτιο, Ιούνιο, Σεπτέµβριο και Δεκέµβριο κάθε έτους, και εκτάκτως όποτε το ζητήσει ο πρόεδρος ή οποιαδήποτε δύο µέλη του Δ.Σ. µε γραπτή αίτησή τους προς τον πρόεδρο.
Τόσο τα µέλη του Διοικητικού Συµβουλίου όσο και τα µέλη της Συµβουλευτικής Επιτροπής προσφέρουν τις υπηρεσίες τους αµισθί.
Μανιατάκης Δημήτρης-Αντώνης
Πρόεδρος Δ.Σ., Οικονομολόγος-Επιχειρηματίας
Ταγωνίδη-Μανιατάκη Ελένη
Αντιπρόεδρος Δ.Σ., Λογοτέχνης
Μαντζάρα Λένα
Γραμματέας, Δικηγόρος
Κυριόπουλος Άγγελος
Ταμίας, Οικονομολόγος
Καρβέλας Παναγιώτης
Μέλος Δ.Σ., Δήμαρχος Πύλου-Νέστορος
Nanetti Andrea
Μέλος Δ.Σ., Καθηγητής Ιστορίας στο Nanyanng Technological University Σιγκαπούρη
Αγγελόπουλος Παναγιώτης
Μέλος Δ.Σ., Οικονομολόγος
Καραμάνος Ανδρεας
Μέλος Δ.Σ., Καθηγητής Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Μέργος Γεώργιος
Μέλος Δ.Σ., Ομότιμος Καθηγητής Τμήματος Οικονομικών Επιστημών, ΕΚΠΑ
Μητροπολίτης Μεσσηνίας Χρυσόστομος
Μέλος Δ.Σ., Καθηγητής Θεολογίας, Ε.Κ.Π.Α.
Τριχοπούλου Αντωνία
Μέλος Δ.Σ., Πρόεδρος του Ελληνικού Ιδρύματος Υγείας
Τα µέλη της Συµβουλευτικής Επιτροπής γνωµοδοτούν επί θεµάτων που τίθενται από το Δ.Σ., εισηγούνται κατευθύνσεις και ενέργειες που κρίνουν σκόπιµο να ενταχθούν στο πρόγραµµα δραστηριοτήτων του Ιδρύµατος, καθώς και την ανάληψη δράσης κατά προτεραιότητα σε τοµείς που θεωρούν σηµαντικούς.